人体肠道含有各种各样微生物，如细菌、真菌、寄生虫和病毒。超过1亿细菌定植于消化道，是人体细胞的10-100倍。人类经过漫长的进化，肠道微生物和机体已经成了相对和谐的共生状态。
有人戏称，我们=10%的人体细胞+90%的细菌，更有人认为，也许这些菌群才是人身体真正的主宰。尽管这些都是玩笑，近期一系列的研究发现：肠道菌群与人类的行为情绪有着奇妙的关联。
美国营养学界有句谚语：You are what kind of bacterial you have（你体内的细菌决定了你的性格）。这句话是有出处的，实际上来源于《美国国家科学院院刊》（PNAS）2015年发表的一篇新闻特稿——“细菌影响大脑”（Microbes on the mind），文章的主角就是“肠道内的菌群军团”。
中枢神经系统与消化道关系密切，在调节肠道功能和代谢平衡方面起重要作用。反过来，肠道也可能影响中枢神经系统和神经细胞，参与调节神经系统功能，影响神经相关疾病的病因和发病进程。因此形成了微生物—肠道—大脑轴的概念，该轴对大脑情绪与行为的影响，已成为世界生命科学学术界进入21世纪的重大科研目标。
研究人员通过一系列的实验发现，肠道无菌小鼠，在被强迫游泳后不会出现抑郁表现，同时也不会出现焦虑的行为。另外，对58名患有重度抑郁症病人和63名健康人的粪便进行微生物多样性检测发现，他们的肠道微生物组成有着显著的差异。在抑郁症病人中，微生物主要来自于3个门类：厚壁菌门，放线菌门和拟杆菌门。研究人员把来自于5个抑郁症病人的粪便移植到无菌小鼠的体内后，无菌小鼠会表现出抑郁行为。相反，移植健康人的粪便不会产生这个结果。
德国最新研究发现，用抗生素杀伤肠道菌群会影响大脑海马体的神经功能，并揭示了Ly6Chi白细胞在参与大脑、免疫系统与肠道通讯中发挥至关重要作用。
美国一项相关研究发现，益生菌对大脑异常行为的改善作用由迷走神经介导，摄入乳酸菌可改善小鼠焦虑情绪，伴随大脑γ-氨基丁酸受体的表达升高。而在切断迷走神经后，改善性作用减弱甚至消失。
同样在美国，另一项研究表明：补充益生菌，可使大脑传递快乐情绪的多巴胺上升大约1倍，缓解抑郁的血清素则上升约20%，而体内压力激素浓度则有降低现象。
此外，还有实验表明，喂食长双歧杆菌以及短双歧杆菌的小鼠面对焦虑时，应激反应强度均会出现不同程度的降低。当然这两种细菌对小鼠性情进行了不同的改造：短双歧杆菌让小鼠变得更加勇敢，而长双歧杆菌则让小鼠在面对压力时，体温不至于变化过快。
所以说，肠道微生物菌群稳定组成是发挥微生物—胃肠—脑轴双向调控的基础。不合理饮食、抗生素使用、饮酒、吸烟以及昼夜节律失调等外界因素会影响微生物组成，在破坏人体微生态稳定的同时直接影响胃肠—中枢神经系统平衡的精确调控，尤以饮食因素影响最大。
消化科专家将肠道比成情绪的晴雨表，这也不难理解。情绪的波动，容易引起暴饮暴食、食欲不振等症状，从而影响到胃肠道正常工作，导致肠胃功能失调，引起腹泻、腹胀、不消化等一系列问题。同样，肠胃道内微生物环境失衡，会引起各种肠道疾病，不仅影响到人的心情，还会使身体健康受损。
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